Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trim68Q8K243 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trim68Q8K243 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trim68Q8K243 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms