Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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SbsnQ8CIT9 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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SbsnQ8CIT9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsnQ8CIT9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms