Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Card11Q8CIS0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Card11Q8CIS0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Card11Q8CIS0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Card11Q8CIS0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Card11Q8CIS0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Card11Q8CIS0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Card11Q8CIS0 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Card11Q8CIS0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Card11Q8CIS0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Card11Q8CIS0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Card11Q8CIS0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Card11Q8CIS0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Card11Q8CIS0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Card11Q8CIS0 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms