Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hpf1Q8CFE2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Hpf1Q8CFE2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hpf1Q8CFE2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hpf1Q8CFE2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hpf1Q8CFE2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hpf1Q8CFE2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hpf1Q8CFE2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hpf1Q8CFE2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hpf1Q8CFE2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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