Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Gm9955Q8CEJ8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Gm9955Q8CEJ8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Gm9955Q8CEJ8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Gm9955Q8CEJ8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Gm9955Q8CEJ8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm9955Q8CEJ8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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