Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc38Q8CDN8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc38Q8CDN8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc38Q8CDN8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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