Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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