Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm43049-201ENSMUST00000198099 462 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Dppa5a-201ENSMUST00000071991 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm5065-201ENSMUST00000056639 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Tnip3-207ENSMUST00000212375 1543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm11827-201ENSMUST00000142297 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trim35Q8C006 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm37309-201ENSMUST00000194994 1639 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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