Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp47Q8BY87 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp47Q8BY87 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp47Q8BY87 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp47Q8BY87 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp47Q8BY87 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp47Q8BY87 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp47Q8BY87 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp47Q8BY87 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp47Q8BY87 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp47Q8BY87 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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