Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Tnfsfm13Q8BXS2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Tnfsfm13Q8BXS2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Tnfsfm13Q8BXS2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Tnfsfm13Q8BXS2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Tnfsfm13Q8BXS2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsfm13Q8BXS2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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