Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ube3dQ8BX13 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ube3dQ8BX13 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ube3dQ8BX13 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ube3dQ8BX13 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ube3dQ8BX13 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ube3dQ8BX13 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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