Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ctdsp2Q8BX07 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ctdsp2Q8BX07 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms