Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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TtpaQ8BWP5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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TtpaQ8BWP5 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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TtpaQ8BWP5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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TtpaQ8BWP5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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TtpaQ8BWP5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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TtpaQ8BWP5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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TtpaQ8BWP5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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TtpaQ8BWP5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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TtpaQ8BWP5 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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TtpaQ8BWP5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TtpaQ8BWP5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms