Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp38Q8BW70 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp38Q8BW70 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Usp38Q8BW70 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp38Q8BW70 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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