Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pggt1bQ8BUY9 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms