Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gpc2Q8BKV1 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gpc2Q8BKV1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gpc2Q8BKV1 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gpc2Q8BKV1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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