Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tspan12Q8BKT6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms