Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Zbed4Q80WQ9 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Zbed4Q80WQ9 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155 ms