Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms