Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cfap100Q80VN0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms