Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpp38Q80UU2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms