Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Avl9Q80U56 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Avl9Q80U56 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Avl9Q80U56 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Avl9Q80U56 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Avl9Q80U56 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Avl9Q80U56 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Avl9Q80U56 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Avl9Q80U56 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Avl9Q80U56 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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