Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ube2q1Q7TSS2 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ube2q1Q7TSS2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ube2q1Q7TSS2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ube2q1Q7TSS2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ube2q1Q7TSS2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ube2q1Q7TSS2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ube2q1Q7TSS2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ube2q1Q7TSS2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ube2q1Q7TSS2 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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