Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Dsg1bQ7TSF1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms