Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Actn1Q7TPR4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Actn1Q7TPR4 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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