Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Uhrf2Q7TMI3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Uhrf2Q7TMI3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms