Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx13Q6PHS6 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms