Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmeff1Q6PFE7 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmeff1Q6PFE7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmeff1Q6PFE7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmeff1Q6PFE7 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmeff1Q6PFE7 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmeff1Q6PFE7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms