Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm4Q6IRU2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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