Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nop58Q6DFW4 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms