Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Pkp4Q68FH0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pkp4Q68FH0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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