Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctnna3Q65CL1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctnna3Q65CL1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms