Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc18Q640L5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Ccdc18Q640L5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Ccdc18Q640L5 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Ccdc18Q640L5 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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Ccdc18Q640L5 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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