Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sall3Q62255 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sall3Q62255 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms