Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Klf3Q60980 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms