Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbbp4Q60972 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms