Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RelnQ60841 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RelnQ60841 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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