Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atf3Q60765 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms