Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 2610017A05Rik-201ENSMUST00000204670 1661 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mkrn3Q60764 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms