Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tnfsf15Q5UBV8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms