Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Mdc1Q5PSV9 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Mdc1Q5PSV9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Mdc1Q5PSV9 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Mdc1Q5PSV9 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Mdc1Q5PSV9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Mdc1Q5PSV9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Mdc1Q5PSV9 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Mdc1Q5PSV9 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mdc1Q5PSV9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms