Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trim58Q5NCC9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trim58Q5NCC9 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trim58Q5NCC9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trim58Q5NCC9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trim58Q5NCC9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trim58Q5NCC9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trim58Q5NCC9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trim58Q5NCC9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trim58Q5NCC9 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trim58Q5NCC9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trim58Q5NCC9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim58Q5NCC9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim58Q5NCC9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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