Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Fam220aQ3ZN08 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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