Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r223-201ENSMUST00000091719 1086 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms