Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms