Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp19Q3UJD6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms