Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b2Q3UJB0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms