Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccdc34Q3UI66 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ccdc34Q3UI66 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms