Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 2900076A07Rik-203ENSMUST00000180879 725 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm32856-202ENSMUST00000212180 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms