Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rnf180Q3U827 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Rnf180Q3U827 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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